San Francisco. Nicolas et Pernelle Flamel ont une dernière mission à accomplir : sauver la ville des griffes des monstres échappés de l'île d'Alcatraz.... Mais même avec le secours des deux plus grands guerriers de l'histoire, la sorcière et le légendaire alchimiste pourront-ils défendre la ville ? Ou serait-ce le début de la fin de la race humaine ?...